和一般平地所抽的淡水不同，學區內的地下水資源受到長期超抽的影響，再加上地緣上近海的因素，使得水質呈台語俗稱的「半鹹水」狀態，亦即所謂的「鹽化」，這對養殖漁業而言，正好適合廣鹽性漁產的養殖。可惜的是，長久以來，抽取地下水資源的行為並無法作最佳的管控，地下水因被抽取而流失的狀況，遠超過自然水資源的補充，淡水的地下水層在供需不平衡的狀況下，帶鹽分的海水地下水層逐步入侵到內陸，使得學區附近，甚至濱海地區其他的鄉鎮，地下水資源逐漸受鹽化影響。

受地層下陷、海水入侵地下水層的多重影響，導致學區內另一項一直困擾本地居民及學校的問題─「土壤鹽化」。由於土壤鹽化的緣故，伴隨而來的是學區內的農作物種植及種類受限，及其他植物的難以存活，經年累月之下，也對建築物造成了無情的破壞。